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Vétérinaire Tim Barbé

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Envoi d’un échantillon au laboratoire

Je souhaite envoyer un échantillon pour analyse au laboratoire des poissons
Dans notre laboratoire, nous testons non seulement les échantillons collectés lors des tournées quotidiennes, mais nous recevons également des échantillons provenant du pays et de l’étranger, tant de la part de professionnels que de particuliers.
Vous voulez faire examiner un poisson que vous venez d’acheter pour le KHV, le CEV ? Vous avez un problème dans votre étang et vous souhaitez vérifier si l’un des agents pathogènes de notre gamme joue un rôle dans le processus de la maladie ? Vous pouvez le faire ! Mais il est important de tenir compte de quelques exigences :

– La qualité du diagnostic dépend de la qualité de l’échantillon. C’est-à-dire qu’avant tout, l’échantillon doit être prélevé correctement. Ensuite, l’échantillon doit être stocké et expédié correctement. Plus de détails sont décrits ci-dessous !

– L’interprétation des résultats n’est pas toujours aussi évidente ou directe. Les termes utilisés ou la connaissance de la présence ou non de pathogènes dans l’échantillon ne sont pas à la portée de tous. Il est donc préférable de demander l’aide d’un vétérinaire.

– Nous agissons en tant qu’intermédiaires, nous pouvons donner des conseils sur les tests possibles et utiles, expliquer les résultats, mais nous n’entreprenons pas de traitement à la suite de nos conclusions.

– S’il s’agit d’un prélèvement pour « culture microbienne avec antibiogramme », il est indispensable d’indiquer sur le formulaire le vétérinaire référent et ses coordonnées ! Ce dernier peut interpréter les résultats et les convertir en traitement ciblé. Par exemple, il sait ce que signifie une sensibilité intermédiaire d’un germe et si un traitement peut alors être mis en place pour ce germe… connaît le nom des différentes molécules mentionnées sur le rapport et sait comment les appliquer et à quelle dose.
– Si notre vétérinaire doit effectuer cette interprétation pour vous, un supplément vous sera facturé. Selon la loi, les antibiotiques ne peuvent pas être distribués librement sans que nous ayons examiné les animaux !

– Avant de publier les résultats des analyses, les coûts doivent être reçus sur notre compte ! Pour que le processus se déroule sans encombre : informez-nous toujours de l’envoi des échantillons, envoyez-nous le formulaire d’anamnèse si nécessaire (vous pouvez le télécharger ici sur le site). Une fois les échantillons reçus, nous vous enverrons un accusé de réception avec la facture. En fonction du délai d’exécution des analyses demandées, vous disposerez alors d’au moins 24 heures pour déposer l’argent et fournir une preuve de paiement, le cas échéant.

– Nous recevrons plusieurs échantillons, sans le formulaire d’anamnèse, nous ne pouvons pas savoir exactement ce qui est attendu, de qui provient l’échantillon et à qui le résultat doit être envoyé !

– N’oubliez pas que les échantillons envoyés par la poste peuvent prendre un certain temps avant d’arriver et qu’au pire, ils peuvent être perdus ou endommagés. Assurez-vous que vous disposez du bon affranchissement, d’un matériel solide et d’un emballage correct (un écouvillon dans une enveloppe standard avec 1 timbre risque d’être endommagé dans la machine de tri postal !) Les échantillons en provenance des Pays-Bas mettent parfois une semaine à arriver !

Comment prélever un échantillon correct en vue d'une analyse ultérieure ?
La personne la plus apte à prélever correctement un échantillon est un vétérinaire spécialisé dans les poissons. Nous recevons parfois des échantillons pathétiques, par exemple des morceaux de branchies introduits dans un milieu de culture bactériologique pour un test de dépistage du KHV. Nous rappelons que la qualité du diagnostic dépend de la qualité de l’échantillon ! Sachez également qu’un seul résultat de l’étude n’est pas forcément exhaustif. Un poisson atteint du CEV peut également être positif au KHV ! Les

L’inconvénient d’une PCR unique est qu’elle permet d’étudier spécifiquement un agent pathogène, alors que de nombreuses pathologies, en particulier en été, sont multifactorielles.

PCR

Pour les analyses par PCR, il est important de recevoir de l’ADN intact. Après la mort, les protéines et les tissus se dénaturent et se décomposent. Il est donc important de prélever des échantillons pour la PCR, de préférence dans les 24 heures suivant le décès. Vous mettez également l’échantillon dans de l’alcool à au moins 70° (éthanol, isopropanol). Un petit morceau de tissu dans un petit tube avec une petite quantité d’alcool suffit. Vous pouvez combiner jusqu’à 2 poissons dans un seul échantillon, par exemple un morceau de branchies de 2 koïs dans un seul tube. Pour le dépistage, il est utile de connaître le statut de deux poissons simultanément. En cas de maladie, vous pouvez avoir des échantillons d’un poisson qui a été euthanasié parce qu’il était trop malade, mais vous avez un autre poisson présentant des symptômes dont vous pouvez également ajouter un morceau de branchie, par exemple. Pour les processus pathologiques, il faut toujours prélever un échantillon sur un poisson présentant des symptômes, même si vous avez le KHV dans votre étang, les poissons en bonne santé peuvent être négatifs !

Tout bocal ou tube qui se ferme correctement peut servir de récipient. Il est évident qu’il faut s’assurer qu’il est propre au départ. L’alcool désinfectant que l’on trouve dans les pharmacies domestiques convient parfaitement comme agent de conservation.

Examen microbiologique
L’intérêt d’un écouvillon est de toucher les bactéries qui se nourrissent actuellement de la peau de votre poisson. Tout comme sur notre peau, les bactéries, y compris Aeromonas, sont toujours présentes dans les poissons sains. Lorsque la peau d’un poisson n’est plus intacte, les bactéries environnementales ne peuvent plus être éliminées, ce qui fait d’une plaie un terrain propice à la prolifération simultanée de toutes sortes de bactéries. Créer une culture d’entreprise

ne révèle donc pas toujours la bonne bactérie responsable. Il est préférable d’insérer l’écouvillon profondément dans la peau, au bord d’une lésion. Souvent, vos poissons présentent des lésions à plusieurs endroits. Dans ce cas, prélevez l’endroit le plus jeune et le plus actif, où les bactéries sont encore en pleine croissance sans emporter de saletés et de matières mortes. Bien entendu, il est important que l’écouvillon soit stérile avant de percer la peau de votre poisson et que vous ne préleviez l’écouvillon qu’à un seul endroit. Nous recommandons vivement d’effectuer deux prélèvements distincts en cas de maladie des trous. De préférence, il s’agit de deux poissons différents. Nous mettons les deux écouvillons en culture, nous les interprétons et nous procédons à l’analyse de ceux qui semblent jouer un rôle dans le processus de la maladie. Ne laissez pas tomber un écouvillon stérile sur le sol, ne faites pas de piqûres accidentelles dans l’eau de l’étang, ne faites pas de piqûres au centre d’une blessure non plus ou vraiment dans la pourriture d’une branchie nécrosée. Ces problèmes peuvent avoir une incidence négative sur les résultats.

Les écouvillons peuvent être obtenus auprès de votre médecin, de votre vétérinaire ou parfois en pharmacie. Ceux-ci doivent être stériles et contenir un milieu de transport pour maintenir les germes en vie pendant le transport ! Si nécessaire, regardez l’image pour voir un exemple d’écouvillon approprié.

Analyse de l'eau
Nous recevons généralement des échantillons pour la détermination des métaux (lourds) (Cu-Fe-Zn). Il est préférable de déterminer la plupart des paramètres à l’aide d’un kit d’essai standard dans l’étang, car les paramètres tels que l’oxygène, l’ammoniac et les nitrites peuvent encore changer dans le récipient sous l’influence des processus biologiques qui se déroulent dans l’échantillon. Plus l’eau est chaude, plus les changements sont rapides. Si l’acier peut être maintenu froid, ce n’est pas trop grave. Pour chaque paramètre à tester, 25 ml d’eau devraient suffire, mais il est préférable de prévoir une réserve supplémentaire.

On nous envoie également de l’eau pour déterminer la pression de germination. Pour cela, nous n’avons pas besoin de beaucoup d’eau, mais il est particulièrement important de commencer à prélever l’échantillon à un moment où il n’y a pas eu de perturbation dans l’étang et au cours d’une journée moyenne. Pas si les filtres n’ont pas été vidés pendant des semaines, par exemple, pas même après le remplissage de l’étang, pas lors d’un traitement avec des produits désinfectants, pas si l’étang vient d’être considérablement remué, ce qui a entraîné un remaniement de la vase,…
Un pot stérile est le plus approprié. Vous pouvez également acheter au supermarché une nouvelle bouteille d’eau potable scellée (33cl ou 50cl, par exemple), la vider et la remplir immédiatement avec de l’eau de l’étang (sans air) et l’envoyer. Pour les tests toxicologiques, au moins 1 litre d’eau doit être disponible et doit être apporté ensemble à la faculté vétérinaire de l’UGent.

Formulaire d’analyse